SMPDB小分子通路
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SMPDB小分子通路

SMPDB是一个交互的、可视的小分子通路的数据库,包含910条手绘小分子代谢通路,其中468条药物通路,232条疾病通路,105条代谢通路,100多条其他通路。

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SMPDB(The Small Molecule Pathway Database)

The Small Molecule Pathway Database(SMPDB)由加拿大卫生研究院、阿尔伯塔大学和加拿大代谢组学创新中心共同创建,是一个交互的、可视的小分子通路的数据库,包含910条手绘小分子代谢通路,其中468条药物通路,232条疾病通路,105条代谢通路,100多条其他通路。这些通路中百分之七十以上不能在任何其他通路数据库中找到。SMPDB特别为临床代谢组学、转录组学,蛋白质组学和系统生物学中通路阐释和通路发现而设计。SMPDB提供了巧妙详细地人类代谢通路、代谢疾病通路、代谢物信号通路和药物活性通路的超级链接图表。每个小分子和人类代谢组数据库(HMDB)或DrugBank中包含的详细描述进行超链接,而每个蛋白质或酶复合物和UniProt进行超链接。该库方便浏览,并支持全文搜索。用户能够用一列代谢物名字、药物名字、基因/蛋白质名字、SwissProt ID,Affymetrix ID或Agilent微阵列ID来查询SMPDB。这些查询将产生一列匹配的通路,并在每个通路图表中高亮显示匹配的分子。基因、代谢物和蛋白质浓度数据也可以通过SMPBD的映射界面进行可视化。所有SMPDB的图像、图像映射、描述和表都是可下载的。

 

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