人类代谢组数据库(HMDB)
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人类代谢组数据库(HMDB)

人类代谢组数据库(www.hmdb.ca)是一个基于Web的代谢组学数据库,其中包含有关人类代谢物及其生物学作用,生理浓度,疾病关联,化学反应,代谢途径和参考光谱的全面信息。

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人类代谢组数据库(www.hmdb.ca)是一个基于Web的代谢组学数据库,其中包含有关人类代谢物及其生物学作用,生理浓度,疾病关联,化学反应,代谢途径参考光谱的全面信息。

人类代谢数据库(HMDB)是一个全面的、免费的网络资源,包含了有关人体代谢物的详细信息。人体代谢物是指在人体内发现的小分子,包括肽、脂类、氨基酸、核酸、碳水化合物、有机酸、生物胺、维生素、矿物质、食品添加剂、药物、化妆品、污染物,以及人类摄入、代谢、分解或接触的任何其他化学物质。代谢组学的发展(即代谢体的研究)的关键是代谢组学数据库的开发。就像基因组学和蛋白质组学依赖于GenBank和UniProt中的参考序列来注释基因和蛋白质一样,代谢组学也至关重要地依赖于参考化合物数据和参考光谱数据来注释代谢物。尽管存在许多“代谢”数据库,例如KEGG,Reactome和Cyc数据库,但真正的“代谢组学”数据库却相对较少。一些较著名的代谢组学数据库包括Metlin,MetaboLights,Metabolomics Workbench,Lipid Maps和HMDB。

通常代谢组学检测结果中同学们会拿到代谢物质定性列表,从这个定性列表中,至少咱们肯定能够获得的信息便是代谢物名称,若要了解这些代谢物的更多详细信息(分子式、精确分子量、CAS号、物质分类等),咱们可以利用代谢物名称(如:Rutin芦丁)在HMDB数据库进行检索,得到结果如下(http://www.hmdb.ca/metabolites/HMDB0003249):

1、定性信息

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2、物质分类

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3、标准谱图信息

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4、其他数据库链接

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